1884 Församlingen kan räkna sina rötter från 25 maj 1884 då de utflyttade från Betelkapellet i Stockholm och bildade Sicklaö baptistförsamling.
1906 22 mars 1906 ändrades namnet till Skuru baptistförsamling.
1961 1961 ändrades namnet till Nacka baptistförsamling.
1988 På grund av svikande medlemsantal upplöstes församlingen 10 november 1988
Verksamheten har genom åren bestått av Gudstjänster, söndagsskola,ungdomsverksamhet och scouter. I samband med upplösandet hade nu Baptistsamfundet genom egna studier förstått att frikyrkligheten i Nacka var låg och beslutat att göra något åt detta.
1991 Personer bl.a från tidigare Nacka Baptistförsamling engagerades i projektet vilket ledde till att församlingen Kyrkan i Nacka Centrum bildades 20 januari 1991.
1994 Nuvarande kyrkobyggnad invigdes 11 december 1994.
2010 Namnet ändrades till Forumkyrkan i Nacka 2010
2019 Namnet ändrades till Equmeniakyrkan Nacka Centrum 2019. Ett samarbetsavtal tecknades mellan Equmeniakyrkan Nacka Centrum och Nacka Församling
2020 Kyrkan såldes till Nacka församling vilket officiellt skedde 26 januari 2020.